AFAIK, não há como fazer com que o PHP faça isso.
O que você provavelmente precisa fazer é simplesmente ajustar seu aplicativo PHP para operar de maneira semelhante ao modo como o Drupal e outros aplicativos PHP funcionam. Várias configurações são colocadas em uma estrutura de diretórios assim.
/config/all
/config/blah.example.org
/config/example.org
Basicamente, o aplicativo PHP examinará o FQDN no pedido de entrada pretendido, depois tentará carregar uma configuração para ele e, em seguida, tentará locais menos específicos até que ele selecione a configuração padrão de todos os sites.