Se os dois sites compartilharem o mesmo caminho físico, eles também compartilharão a configuração por design.
Configure o caminho físico do site "domain.com" para uma pasta vazia na qual a identidade "Anônimo" ( IUSR
por padrão, caso contrário, a identidade do pool de aplicativos) tenha acesso para ler e executar e reconfigure sua Regra de redirecionamento http para redirecionar todas as solicitações para o link