Bem, dois suspeitos:
- Sobrecarga de rede, especialmente no lado do servidor. Esses links de rede de 1gigabit só têm servidor 100mb / segundo total, e isso pode ser MUITO baixo ... talvez o tempo tpo atualize o switch para um plugável para lidar com um pequeno número de links de 10giga e coloque um cartão de 10giga no servidor.
- Sobrecarga de disco;)
No seu caso, verifique também a sobrecarga do VmWare. Especialmente de volta ao SAN ... Parece uma configuração muito estranha que você tem lá. Trabalhando, mas não escalável.