Você precisa configurar um host virtual apenas para x.y.com na porta 443 e somente y.com para a porta 80.
Namevirtualhost *:80
Namevirtualhost *443
<VirtualHost *:443>
SSLEngine on
SSLCertificateFile "conf/ssl.crt/certificate.crt"
SSLCertificateKeyFile "conf/ssl.key/certificate.key"
SSLCertificateChainFile "conf/ssl.crt/chain-file.ca-bundle"
ServerAdmin [email protected]
DocumentRoot "C:/apache/htsecure/"
ServerName secure.u4ik.us
ServerAlias secure.u4ik.us
</VirtualHost>
<VirtualHost *:80>
ServerAdmin [email protected]
DocumentRoot "C:/apache/htdocs/"
ServerName u4ik.us
ServerAlias www.u4ik.us
</VirtualHost>
Observe as duas raízes diferentes do documento. Observe também que eles escutam um domínio específico. Para a outra parte de fazer todos os subdomínios ir para x.y.com, use mod_rewrite:
Coloque isto no arquivo .htaccess:
<IfModule mod_rewrite.c>
Options +FollowSymLinks
Options +Indexes
RewriteEngine On
RewriteBase /
RewriteCond %{HTTP_HOST} !www.domain.com$ [NC]
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^(www.)?([a-z0-9-]+).domain.com [NC]
RewriteRule (.*) %2/$1 [L]
</IfModule>