Acho que você entendeu corretamente, uma consulta que faz referência a tabelas que não são replicadas falhará no escravo, fazendo com que a replicação seja interrompida. Você poderia criar tabelas fictícias no escravo para que a junção fosse bem-sucedida, mas se os resultados da consulta fossem afetados, a atualização no escravo não corresponderia ao mestre e os dois seriam divergentes.