Eu tenho uma tela dupla funcionando corretamente no meu laptop com o Ubuntu 15.10 e o Mate.
O problema é que a "lista do Windows" no meu painel não está mostrando os nomes das janelas exibidas na segunda tela. Eu sei que eu posso configurar as "Preferências de lista do Windows" para mostrar janelas de todo o espaço de trabalho, mas não há nenhum link. Esta é a mesma área de trabalho, apenas outra tela ...
Não é uma solução perfeita, mas achei isso em outro fórum e funciona para mim. Crie um novo painel na segunda tela (clique com o botão direito do mouse no painel e selecione Novo painel, desmarque a caixa de expansão. Você pode arrastar o painel para o segundo monitor.) E outro Windows Listar para o novo painel e ele exibirá as janelas a tela.