Não há mais funcionalidade de controlador de domínio principal / de backup no Active Directory. Tudo é tratado por papéis.
Em suma, você deseja: promover o servidor de 2008 para se tornar um controlador de domínio, transferir todas as funções para ele e, em seguida, remover a caixa SBS de 2003.
Aqui está um artigo da Technet Wiki para você começar: Migrando DCs do AD de 2003 para 2008 (links para o artigo completo no final)