Quando migramos nossos usuários de nossa instância do OCS 2007R2 para nossa instância do Lync, descobrimos que o cliente do 2007R2 teria o prazer de entrar no pool de lync sem reclamar. Isso tornou a vida muito mais fácil, já que tudo o que precisávamos fazer era o cmdlet move-cslegacyuser em relação à base de usuários inteira e, em seguida, poderíamos atualizá-los para o cliente Lync à vontade.
Não tenho certeza se testou ou não o cliente OCS 2007R2 contra o pool lync, mas dê uma chance. Se você tem e ele falha, deve haver um comando para habilitá-lo que eu de alguma forma habilitei como resultado de outra alteração, porque posso garantir que o Office Communicator Client funcionou muito bem em um pool corporativo do Lync.
Desculpe, não posso ser mais específico, mas espero que o simples fato de eu estar lhe dizendo que é possível tornará mais fácil encontrar a solução.