O Lync é muito melhor que o OCS 2007, isso se deve ao construtor de topologia, entre outras coisas.
Sem mencionar que não há mais mmc, mas você tem um ótimo aplicativo web silverlight e um grande powershell cheio de guloseimas. Veja os documentos do technet lync, pois eles são muito bem feitos e constantemente atualizados.
Veja: Blog de Jeff Schertz para uma boa introdução passo a passo: link
Também há um bom livro de Alex Lewis e Crew: link