Eu pessoalmente inclino-me para uma pasta compartilhada para esse tipo de coisa. Mas depende exatamente de como você está usando. (Eu recomendaria seguir o conselho de Mark para mais contexto)
Para o Linux, a coisa mais fácil seria usar montagens NFS. Você pode fazer isso de duas maneiras. Ou 1) exporte a pasta de um dos dois servidores e monte o outro, ou 2) tenha um servidor separado (isto é: um servidor de arquivos centralizado) exporte uma pasta e faça com que os dois servidores a montem. Documentação genérica sobre como usar o NFS pode ser feita em todo o lugar. Mas pare de falar se você precisar de detalhes.
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