As configurações que você deseja modificar (prefork.c / worker.c / mpm_winnt.c) não ajudarão no (s) problema (s) que você está tendo. Essas configurações são usadas para ajustar a desova e seleção de filhos ou segmentos do Apache para atender a solicitações individuais.
Seus ganhos reais de desempenho provavelmente estarão na área de seu banco de dados ou de sua linguagem de script (PHP neste caso). Seu servidor da Web fornecerá apenas melhorias incrementais por comparação. Para testar essa afirmação é fácil: basta lançar um arquivo estático em algum lugar do servidor ("helloworld.txt" ou similar) e solicitá-lo algumas vezes. Eu praticamente garanto que ele carrega como um campeão. Exceto circunstâncias muito estranhas - como o Apache causando a troca - o ajuste do Apache em si não é a resposta aqui.