configure é usado como parte do processo de criação padrão ( configure , make , make install ) para verificar várias dependências para diferentes sistemas.
A configuração foi concluída com êxito, portanto, se make e make install funcionarem, você estará bem, a menos que esteja faltando recursos necessários.
Portanto, as coisas que faltam provavelmente são otimizações ou não são aplicáveis ao seu sistema (por exemplo, alguns desses cabeçalhos podem ser apenas para o OS X ou BSD).