Se você mantiver o MS Best Practices e APENAS colocar a função do Hyper-V nesse servidor, os únicos arquivos importantes são os arquivos .vhd, snapshots e vm config. Outros, em seguida, chamando a Microsoft para ajudá-lo a reparar o sistema operacional, você poderia fazer uma instalação no host por cima de si mesmo e, em seguida, adicionar novamente as VMs. Você precisaria de acesso IP KVM. Eu fiz janelas remotas instaladas sobre IP KVM para reinstalar o sistema operacional limpo (DVD expandido ISO para a unidade C:) e levou algumas horas. Ele não tocará em outros drivers ou na maioria das pastas, desde que haja espaço em C:.