Primeiro, parece que você tem um domínio (se você tem um controlador de domínio, tem um domínio). Um domínio é um contexto de segurança (kerberos, ntlanman etc), portanto, não é apenas um conjunto de nomes de conta.
Esta não é uma operação simples ou segura (se você estiver usando atualmente credenciais de domínio em outros locais da organização), bem como problemas com o SharePoint (e possivelmente o SQL). Todas as soluções dependem dos recursos disponíveis. Você pode exportar as contas de várias maneiras (no entanto, você perderá senhas se usar a maioria desses serviços) se tiver algum hardware que possa usar ADMT para migrar usuários.
O Sharepoint será um conjunto de desafios diferente, mas semelhante, embora não seja tão doloroso ler Atualização e migração: operações do Stsadm (Windows SharePoint Services) e algumas notas sobre STSADM –o migrateuser .
Como sempre, tenha um backup antes de qualquer alteração em qualquer peça.