Você não pode removê-los do histórico sem quebrar tudo para pessoas que já clonaram o seu repositório, e isso é difícil e demorado de qualquer maneira. Basta removê-los com git rm <...> e enviar seu changeset.
Então, eu tenho o próximo problema. Por exemplo, meu arquivo gitignore contém isto: %código% Se este for meu primeiro push para exibir o servidor git remoto depois que os arquivos descritos não forem enviados. Mas se eu pelo menos uma vez enviasse esses arquivos sem o gitignore, então o gitignore feito contém: %código% O Git vai empurrar esses arquivos também. Então, como posso gitignore já enviar arquivos para os próximos commits?