Ah, agora provavelmente ficaria mais tentado a instalar o GRUB nos discos reais, não no dispositivo md0.
grub> root (hd0,0)
grub> setup (hd0)
grub> root (hd1,0)
grub> setup (hd1)
Como assim, o carregador de inicialização vê os discos como discos primeiro e não precisa carregar um módulo para fazê-lo funcionar. Também é compatível com versões anteriores do GRUB, comparado ao GRUB2. É um pouco como você tem uma partição separada / boot que é RAID1.