são as duas máquinas na mesma sub-rede ip?
como é a estrutura de arquivos (muitos arquivos pequenos?)
qual é o subsistema de disco que esses vm's estão usando?
se estiver demorando 3 horas, você está com cerca de 7MB / por segundo
você pode fazer um arquivo de 1GB e copiá-lo para outra parte do mesmo disco em cada um dos vm's?
no windows você pode criar um arquivo de 1gb com o seguinte comando:
fsutil file createnew file.txt 1024000000
no linux:
dd if=/dev/zero of=file.txt bs=1k count=1000
isso pode dizer se é o sistema de disco subjacente ou a configuração de rede.