As informações da tabela de leitura podem ser um processo intensivo, dependendo do tamanho ou da carga no banco de dados.
Enquanto você matou o processo do sistema executando o comando MySQL, você provavelmente não terminou a conexão com o MySQL.
Execute mysql -A DATABASE ou apenas mysql , observe a lista de processos com show full processlist; e se você deseja que a conexão termine a execução kill processnumber; .