Eu olhei os locais normais, msconfig, run, runonce para algo que faria isso funcionar na inicialização e não consigo entender. Alguém tem alguma idéia de por que as Propriedades do Sistema se abrem sempre que alguém faz login nesse servidor?
Você pode baixar autoruns da Sysinternals - que lhe dará todos os lugares onde as coisas podem possivelmente iniciar automaticamente e mostrar o que é lançado a partir daí.
Encontre a entrada Propriedades do sistema e desmarque a caixa e o problema deve desaparecer.
Tente recriar o perfil padrão de um usuário em que você verificou que todos os locais "executados" no registro estão limpos, exclua todos os perfis dos usuários e deixe-os recriarem a partir do perfil padrão.
Além disso, procure em qualquer script de logon que possa ser atribuído a qualquer usuário por meio de política de grupo ou política local.