Se você tiver apenas alguns usuários, será mais fácil desconectá-los do domínio antigo e reconectá-los ao novo domínio. Lembre-se que você tem que criar todas as novas contas de usuário (mesmo que as novas contas tenham o mesmo nome, elas terão SIDs diferentes e, portanto, serão consideradas diferentes pelo Windows). Isso pode significar que os usuários perdem algumas configurações e / ou dados. Uma boa estratégia de backup será importante!
No entanto, se você tiver mais de um punhado de usuários, se tiver muitos dados ou e-mails para migrar, se seus usuários avaliarem suas configurações e dados ou se você precisar manter sua organização do Active Directory intacta, será necessário executar uma migração do servidor. A Microsoft tem um procedimento de migração totalmente documentado, no entanto, sei por experiência amarga que nem sempre funciona sem problemas. Eu recomendo strongmente que você visite o site www.sbsmigration.com e investigue o processo de Swing Migration. Se você falar com Jeff Middleton (MVP do Small Business Server), diga a ele que eu enviei você.
Você pode acompanhar algumas das minhas experiências com o processo de migração da Microsoft no meu blog, onde há também uma resenha de um livro que você pode achar útil.