Tente rotacionar seus arquivos de log com o logrotate diariamente.
Temos uma máquina debian rodando com firewall / gateway. Nós implantamos o darkstat nele.
Quando instalamos o darkstat, ele estava mostrando as estatísticas corretamente. Depois de alguns dias, parou de mostrar estatísticas recentes. Os dados foram adicionados ao existente. Por favor, alguém me diga qual poderia ser o problema.