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A complexidade da tarefa dependerá se você particionou e formatou todo o seu espaço local para o ESX. Se você não deixou nenhum para VMFS, provavelmente seria mais fácil reinstalar o ESX. No caso em que você está executando o ESXi em um pen drive e não tem discos rígidos ou um controlador compatível, você terá que executar seu armazenamento em outro lugar (por exemplo, freenas, openfiler, compartilhamento NFS)