Você tem o pacote xcalib instalado? ( sudo apt-get install xcalib
)
Este pacote permite inverter as cores da tela para melhor legibilidade dos documentos, etc.
Para inverter as cores (e re-inverter) execute xcalib -i -a
na linha de comando.
Se não, eu iria testá-lo com tela externa e verificar se é o mesmo (se for diferente, então você tem um problema de hardware)