Apenas um pensamento. Se você estiver compartilhando bibliotecas, poderão surgir problemas se você precisar atualizar uma dessas bibliotecas.
Tivemos esse problema há um tempo atrás. Estávamos usando o Zend Framework para alguns projetos com uma única instância do ZF. Um desses projetos precisava atualizar o ZF, para uma versão sem compatibilidade reversa (como 1.7.8 - > 1.8). Para não quebrar os outros projetos, acabamos usando uma instalação separada da ZF para este projeto.
Minha recomendação é usar uma ferramenta de controle de versão, como Git ou SVN, para manter as bibliotecas atualizadas em todos os projetos e colocar essas bibliotecas em um repositório de bibliotecas.