O Office 2003 é seguro, contanto que você esteja executando o SP3 e o patch. A Microsoft continua a fornecer correções de segurança pela duração do ciclo de suporte estendido.
Tivemos um problema semelhante com o Access - alguns usuários tinham aplicativos do Access que eram essenciais para o que estavam fazendo. A solução é bem simples - basta configurar o instalador para deixar o Access 2003 para trás! O KB928091 discute a ordem de instalação e algumas dicas . ( O grande é que você só pode ter uma versão do Outlook )
Na verdade, você está tão bem que esperou, o Office 2007 SP2 corrigiu todos os tipos de erros muito sérios, especialmente com o calendário do Outlook com o Exchange 2007.