Documento especificando o mysql para mssql 2005: link
White papers sobre migração: link
Isto faz referência ao mssql 2005, mas deve ser uma informação muito útil e é diretamente da microsoft.
Existe uma ferramenta no mssql para as principais migrações de banco de dados, mas "Nota: Um Assistente de Migração para migrar do MySQL para o SQL Server ainda não está disponível."