O suporte do Firefox provavelmente depende exatamente de como o script remoto é usado, já que o termo abrange várias tecnologias.
Como uma solução rápida, você pode usar o IETab para incorporar o IE ao Firefox para sites que precisam do IE . Isso, obviamente, requer uma instalação funcional do IE no sistema.
Além disso, você provavelmente terá que analisar a webapp para ver o que ela faz.