Concordo com o comentário de Aaron acima - informações adicionais seriam úteis. Exceto mais informações, porém, aqui estão algumas verificações de alto nível que você pode fazer:
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Quando você restaurou o conjunto de sites, você o fez no mesmo farm? Se você foi entre as fazendas, elas se alinham em termos de service packs e níveis de hotfix? Sabe-se que os diferentes níveis de patch entre a origem e o destino causam problemas.
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Supondo que você esteja simplesmente passando para um aplicativo Web diferente no mesmo farm, examine os conjuntos de recursos que estão ativados. Existe uma chance de que o conjunto de sites (ou a Web que hospeda a biblioteca de documentos) esteja aproveitando um Recurso que não está ativo ou implantado no novo aplicativo da Web? Para o conjunto de sites em sua nova casa?
Por que vale a pena!