O que você precisa é de LVM . Esta é uma camada de abstração de disco diferente das partições que você está usando até agora e as substitui.
O LVM possui instantâneos incorporados que permitem congelar um Volume Lógico existente a qualquer momento, mesmo quando o sistema está em execução. Você pode continuar a usar o volume original normalmente, mas o volume do instantâneo parece ser uma imagem do original, congelado no tempo no momento em que você o criou. Você pode usar isso para obter uma imagem consistente do sistema de arquivos para fazer o backup, sem desligar o sistema. Você também pode usá-lo para salvar o estado do sistema, para depois voltar a esse estado se atrapalhar as coisas. Você pode até montar o volume do instantâneo e fazer alterações nele, sem afetar o original.