Isso geralmente é feito por QoS ou Quality of Service.
No próprio servidor Windows, talvez seja necessário examinar o próprio processo do servidor, por exemplo, muitos servidores ftp oferecem a capacidade de limitar a taxa de download / upload.
Além disso, você precisará de um dispositivo externo que suporte a Qualidade de Serviço, como um roteador Cisco, que pode limitar a largura de banda por conversação.