Problema resolvido ... Um pouco embaraçoso com a simplicidade da solução e com a forma como o problema ocorreu.
Então, chegamos a um ponto em que o suporte da Microsoft nos deu desculpas como essas, não podem nos ajudar porque é um problema de VMware e esse não é o produto deles, devemos contatá-los e talvez seja um erro de hardware datacenter), etc. Eles também nos disseram para inicializar o disco. Uma simples pesquisa no google diz que inicializar o disco fará com que o disco seja formatado. Suporte da Microsoft foi bastante inútil.
Alguns engenheiros de software de recuperação de dados também nos disseram que, neste momento, não é possível corrigir o problema, e nossa única esperança é a recuperação de dados.
Assim, a gerência começou a falar sobre o gasto de milhares em software de recuperação para obter o máximo de dados possível.
Eu encontrei um artigo no SuperUser sobre um programa chamado Testdisk que pode criar uma tabela de partições do zero.
Todo mundo ficou cético a princípio que uma ferramenta gratuita poderia ajudar, mas eu convenci meu chefe a tentar.
Ele tornou o disco virtual de 10 TB legível e acessível novamente em 10 segundos, eu acho.