Não, não há como alterar o UX para o aviso de pop-up. Essa configuração é para os servidores recuperarem recursos, não como um lembrete para os usuários de que eles devem estar funcionando.
No que diz respeito à ação de tempo limite, definida na última configuração 'Encerrar sessão quando o limite de tempo é atingido', você pode desconectar a sessão (o que significa que o usuário pode continuar onde estava quando se reconectar) ou você pode terminar o que faz logoff (habilitar).