Eu observei um tipo similar de reportar minha configuração hoje (CentOS 7.3, HDP 2.5.3, Ambari 2.4.2).
Os arquivos com blocos ausentes que consegui encontrar via:
hdfs fsck / | grep -i 'miss'
hdfs fsck / | grep 'miss' | cut -d ":" -f 1
hdfs fsck / | grep 'Under replicated' | cut -d ":" -f 1
e corrigi-los com:
hdfs dfs -setrep 3 <fileName>