O VLC pode fazer isso através dos ajustes e efeitos > Efeitos de vídeo > Configurações de corte.
o mplayer também pode fazer isso. Use algo como:
mplayer -vf cropdetect=round:16 -ss 10:00 dvd://
Isso mostrará as configurações de recorte detectadas no terminal, algo como 720:416:0:80
, que pode ser usado no filtro de recorte:
mplayer -vf crop=720:416:0:80 dvd://