Esta é a única dica que eu tenho:
Pode ser a indexação de pesquisa do Windows? Isso pode responder por que bloqueia na hora do almoço (quando muitos PCs estão ativados, mas sem atividade) e por que usuários aleatoriamente têm muitas pastas abertas.
Eu tentei excluir do caminho de indexação as unidades de rede mapeadas pelo GPO. Verificarei se esta é a resposta, por isso não consigo entender por que meu servidor falha e por que isso acontece na semana passada e não antes.