Eu posso estar errado, mas eu achei que a presença do recurso IPMI (servidor) no mobo em si previne tanto a GPU onboard baseada na CPU quanto a funcionalidade das placas discretas. Talvez a desativação completa do IPMI (incluindo sua rudimentar GPU móvel) seja suficiente para permitir que os gráficos de outros chips funcionem, mas pelo menos com as placas para servidor SuperMicro, eu nem sabia que isso era possível.
Fonte: discussões on-line sobre transcodificação de sincronização rápida também sendo desativadas pela presença de ipmi.