Nesse caso específico, o alto uso de I / O estava sendo causado por uma tarefa cron executando um conjunto de comandos chmod e chown em uma base regular. Em um host não virtual, esses comandos eram executados muito mais rapidamente, mas dentro do host virtual, esses comandos eram muito mais lentos para executar e causavam altos tempos de espera de disco.
Ao remover esses conjuntos de comandos, o desempenho retornou ao normal e não mais tivemos interrupções estranhas.