Sim, é possível dizer ao Linux para ignorar uma unidade com falha (1) sem desconectá-la fisicamente (2).
Veja esta questão: Como eu adiciono um parâmetro de inicialização do kernel?
Notas de rodapé:
(1) não foi possível há dez meses. Então eu postei a questão ligada porque eu tinha uma falha no SDD, um tipo de desenvolvedor do kernel percebeu isso, adicionou um patch ao kernel, e agora eu tenho um sistema em funcionamento. Este é o verdadeiro poder do Linux.
(2) Embora, se você puder, a melhor estratégia é se livrar fisicamente dela. Sem dreno de energia, sem barulho ...
(3) observe que, obviamente, isso significa que o disco não estará acessível após a inicialização. Será como se não existisse (e isso significa que, por exemplo, no seu caso, o disco que foi /dev/sdb
será agora /dev/sda
e assim por diante). Você pode precisar levar isso em consideração para a configuração de inicialização.