Eu mesmo encontrei a resposta. Pode-se desmarcar a caixa de seleção Configure e o conteúdo do shell Execute pode ser substituído por um liner ou qualquer outra linguagem de script usada.
bash -ex myscript.sh
As pessoas que estão trabalhando no projeto sempre podem editar o arquivo myscript.sh no subversion e, ao mesmo tempo, não têm a possibilidade de configurar o projeto.