Se você estiver usando o Galera com o MySQL 5.6, log_slow_queries foi removido .
Aqui está o que a documentação do MySQL 5.6 diz sobre essa opção
The --log-slow-queries option was removed in MySQL 5.6.1 (along with the log_slow_queries system variable). Instead, use the --slow_query_log option to enable the slow query log and the --slow_query_log_file=file_name option to set the slow query log file name.
Faz com que você coloque as opções corretas sob [mysqld]
group header e não em [mysqld_safe]