Você deve fazer algumas alterações no seu arquivo de configuração do Apache.
Abra o terminal
sudo vim /etc/apache2/sites-available/default
<Directory /var/www/>
Options Indexes FollowSymLinks MultiViews
AllowOverride all
Order allow,deny
allow from all
</Directory>
Faça alterações em AllowOverride None As.
<Directory /var/www/>
Options Indexes FollowSymLinks MultiViews
AllowOverride None
Order allow,deny
allow from all
</Directory>
Agora seu apache não reconhecerá os arquivos .htaccess em seu sistema.