Vendo como podemos ver que a porta padrão está sendo usada para as instâncias mongo , a porta precisa vir dos shardsvr ou configsvr runtimes.
A julgar pelos comentários ...
Sua melhor aposta é verificar se as portas estão sendo usadas pelo conjunto de réplicas.
db.runCommand( { replSetGetStatus : 1 } )
A porta usada deve aparecer na parte name do documento de saída.