Você sempre tem algum tipo de sobrecarga quando armazena seus logs no ES porque ES armazena cada linha de seus logs como documento (em json) com informações adicionadas.
Conte suas linhas de log e compare-as com a contagem de documentos em seu índice para descobrir se há talvez um loop ou uma duplicação de dados.
Mostre-nos o seu elasticsearch.yml para obter mais informações e forneça as informações sobre o tipo de registro que você está enviando para o ES.