Embora alguma parte da configuração do nginx possa se assemelhar ao código do programa, na verdade não é. A ordem é importante apenas para ifs (nem sempre) e para correspondência de localização. Então inclui não são não são analisados por algum ponteiro de instrução hipotética, pelo menos no caso acima. Essa é a razão pela qual sua declaração include funciona, independentemente da correspondência.