Uma coisa que eu verificaria seria a carga do sistema (como é geralmente o caso quando o ventilador acelera), inicie um terminal e digite:
uptime
Para ler mais sobre os valores de carregamento, consulte, por exemplo, este segmento: link
Se parecer alto, você também pode querer ir mais fundo no comando principal:
top
e até checando todo o processo, com
ps -aux
tentando identificar se há aplicativos em execução.