Eu tive quase a mesma situação. O cliente armazenou esses arquivos em uma unidade criptografada através do mdadm e fez uma reinicialização forçada. Depois disso, a pasta / etc / pve foi embora.
Talvez esse seja o seu caso também. Eu acho que o Proxmox armazena alguma configuração na memória e não lida bem com resets hard. Especialmente se você tiver armazenamento complexo como LVM + LUKS + MDADM. Em vez de tentar corrigir dados corrompidos, ele remove toda a configuração deixando os dados privados do contêiner.