De acordo com o Manual do Nano
Você pode configurar ~/.nanorc
para salvar automaticamente ao sair, não solicitar
($:~)=> nano -w ~/.nanorc
# Save automatically on exit, don't prompt
set tempfile
Nota: como @cutrightjm comentou - a configuração acima pode causar grandes problemas nas configurações se você não for cuidadoso e modificar os arquivos e salvar automaticamente ao sair.