Usando perltidy em arquivos com sintaxe inválida pode render ainda mais arquivos de saída quebrados. Também perltidy não sobrescreve o arquivo de origem, a menos que seja instruído.
Você tentou fazer uma
perl -c /etc/amavisd.conf
?
Se isto também produzir este erro, você terá que checar novamente a sintaxe do arquivo de configuração e pedir a alguém para verificar isso para você.
Se este arquivo estiver bem, então provavelmente há outro problema com sua instalação,