Parece que a razão pela qual as regras não se aplicaram foi devido às opções nas tags. / var / www / é um link simbólico para o diretório / home e como resultado da opção FollowSymLinks não ser definida corretamente, alguns dos conteúdos não foram carregados ou carregados (dependendo de onde as condições / regras de reescrita foram colocadas).
A partir da leitura das opções permitidas nos documentos do Apache, você precisa especificar um + ou -:
Note Mixing Options with a + or - with those without is not valid syntax, and will be rejected during server startup by the syntax check with an abort.
Então tudo que eu precisava era modificar a seguinte entrada:
Options +Indexes +FollowSymLinks +ExecCGI
Mais informações aqui: link