Sem conhecer sua configuração específica do sistema operacional convidado, não consigo dizer a você com certeza ou dar um passo a passo exato, mas se você quiser alterar a forma como o Windows é inicializado, você deseja o BCDEdit.
Você pode encontrar um guia de introdução aqui: link
Opções de inicialização mais específicas para versões posteriores do Windows (incluindo o Servidor 2012 e 2008): link